Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFHP12036 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFHP12036 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFHP12036 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFHP12036 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFHP12036 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFHP12036 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFHP12036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFHP12036 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFHP12036 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFHP12036 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFHP12036 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFHP12036 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFHP12036 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFHP12036 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFHP12036 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms