Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP10827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP10827 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP10827 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP10827 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP10827 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP10827 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP10827 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP10827 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP10827 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP10827 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP10827 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP10827 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP10827 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP10827 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP10827 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRAP10827 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms