Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2CP0DJJ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2CP0DJJ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms