Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00032P0C843 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00032P0C843 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms