Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOXF2BP0C7M4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2BP0C7M4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2BP0C7M4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms