Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CT47B1P0C2W7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CT47B1P0C2W7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms