Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN2P0C2S0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN2P0C2S0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms