Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM163BP0C2L3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM163BP0C2L3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM163BP0C2L3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM163BP0C2L3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM163BP0C2L3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms