Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPSAP08865 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPSAP08865 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPSAP08865 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPSAP08865 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPSAP08865 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPSAP08865 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPSAP08865 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPSAP08865 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPSAP08865 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPSAP08865 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPSAP08865 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms