Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGAVP06756 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAVP06756 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms