Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RB1P06400 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RB1P06400 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RB1P06400 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RB1P06400 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RB1P06400 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RB1P06400 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RB1P06400 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RB1P06400 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RB1P06400 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RB1P06400 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RB1P06400 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RB1P06400 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RB1P06400 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RB1P06400 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RB1P06400 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RB1P06400 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RB1P06400 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RB1P06400 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RB1P06400 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RB1P06400 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms