Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCCBP05166 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCCBP05166 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCCBP05166 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCCBP05166 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCBP05166 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCCBP05166 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCBP05166 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCCBP05166 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms