Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCCAP05165 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PCCAP05165 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCCAP05165 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCCAP05165 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCCAP05165 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCCAP05165 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PCCAP05165 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCCAP05165 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCCAP05165 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCCAP05165 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCCAP05165 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PCCAP05165 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCCAP05165 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PCCAP05165 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCCAP05165 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCCAP05165 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCCAP05165 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCCAP05165 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCCAP05165 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCCAP05165 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCCAP05165 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCCAP05165 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCCAP05165 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCCAP05165 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PCCAP05165 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCCAP05165 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCCAP05165 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCCAP05165 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCCAP05165 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms