Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCGP05129 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCGP05129 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms