Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOA2P02652 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOA2P02652 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOA2P02652 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOA2P02652 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOA2P02652 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOA2P02652 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOA2P02652 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOA2P02652 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms