Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFNA21P01568 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFNA21P01568 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms