Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAL4O96015 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAL4O96015 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAL4O96015 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms