Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYF2O95926 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYF2O95926 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYF2O95926 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYF2O95926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYF2O95926 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYF2O95926 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYF2O95926 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYF2O95926 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYF2O95926 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYF2O95926 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYF2O95926 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYF2O95926 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYF2O95926 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYF2O95926 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms