Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL1O95922 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL1O95922 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL1O95922 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms