Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPAN13O95857 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms