Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN7O95471 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN7O95471 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN7O95471 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms