Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEMA3DO95025 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SEMA3DO95025 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3DO95025 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3DO95025 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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