Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF6O94906 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF6O94906 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms