Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms