Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SURF6O75683 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SURF6O75683 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SURF6O75683 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SURF6O75683 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF6O75683 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF6O75683 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF6O75683 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SURF6O75683 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SURF6O75683 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF6O75683 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF6O75683 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SURF6O75683 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SURF6O75683 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SURF6O75683 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SURF6O75683 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SURF6O75683 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SURF6O75683 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SURF6O75683 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SURF6O75683 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SURF6O75683 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SURF6O75683 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms