Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA10O75578 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA10O75578 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA10O75578 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA10O75578 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA10O75578 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA10O75578 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms