Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN11O75508 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN11O75508 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms