Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAMP4O75379 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAMP4O75379 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms