Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA4O75335 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms