Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSVO60911 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSVO60911 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSVO60911 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSVO60911 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSVO60911 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSVO60911 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSVO60911 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSVO60911 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSVO60911 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms