Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR5O60602 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR5O60602 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR5O60602 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR5O60602 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR5O60602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TLR5O60602 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR5O60602 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR5O60602 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR5O60602 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms