Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD2O60548 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD2O60548 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms