Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFDO43915 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFDO43915 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms