Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C21orf2O43822 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C21orf2O43822 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C21orf2O43822 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms