Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP9O43818 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP9O43818 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP9O43818 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP9O43818 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP9O43818 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP9O43818 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP9O43818 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP9O43818 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP9O43818 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP9O43818 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP9O43818 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP9O43818 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP9O43818 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP9O43818 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP9O43818 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP9O43818 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms