Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HTATSF1O43719 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HTATSF1O43719 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms