Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BUD23O43709 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BUD23O43709 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BUD23O43709 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BUD23O43709 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BUD23O43709 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BUD23O43709 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BUD23O43709 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BUD23O43709 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BUD23O43709 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BUD23O43709 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BUD23O43709 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BUD23O43709 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BUD23O43709 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BUD23O43709 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
BUD23O43709 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BUD23O43709 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BUD23O43709 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BUD23O43709 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BUD23O43709 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BUD23O43709 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BUD23O43709 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BUD23O43709 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms