Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCK2O43639 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCK2O43639 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCK2O43639 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCK2O43639 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCK2O43639 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCK2O43639 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCK2O43639 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCK2O43639 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCK2O43639 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCK2O43639 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCK2O43639 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCK2O43639 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCK2O43639 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCK2O43639 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCK2O43639 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms