Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA2O43464 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms