Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID2O43424 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID2O43424 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID2O43424 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRID2O43424 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRID2O43424 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID2O43424 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID2O43424 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRID2O43424 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID2O43424 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID2O43424 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID2O43424 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID2O43424 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID2O43424 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID2O43424 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID2O43424 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms