Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTIFO43310 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTIFO43310 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTIFO43310 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTIFO43310 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTIFO43310 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTIFO43310 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTIFO43310 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTIFO43310 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTIFO43310 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTIFO43310 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTIFO43310 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTIFO43310 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTIFO43310 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTIFO43310 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTIFO43310 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTIFO43310 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTIFO43310 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTIFO43310 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTIFO43310 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTIFO43310 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTIFO43310 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTIFO43310 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTIFO43310 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTIFO43310 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTIFO43310 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTIFO43310 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTIFO43310 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTIFO43310 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTIFO43310 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTIFO43310 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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