Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUPL2O15504 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms