Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PFASO15067 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PFASO15067 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PFASO15067 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PFASO15067 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PFASO15067 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFASO15067 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFASO15067 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFASO15067 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PFASO15067 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PFASO15067 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFASO15067 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFASO15067 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFASO15067 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFASO15067 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PFASO15067 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PFASO15067 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PFASO15067 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PFASO15067 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PFASO15067 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PFASO15067 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PFASO15067 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFASO15067 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFASO15067 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFASO15067 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFASO15067 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFASO15067 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PFASO15067 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PFASO15067 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFASO15067 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFASO15067 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFASO15067 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFASO15067 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PFASO15067 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFASO15067 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFASO15067 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFASO15067 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms