Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN9O14815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN9O14815 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms