Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHOX2AO14813 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHOX2AO14813 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms