Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAFD1O14545 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAFD1O14545 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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