Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF10AO00220 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF10AO00220 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF10AO00220 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms