Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KT08 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
J3KT08 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
J3KT08 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
J3KT08 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
J3KT08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
J3KT08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
J3KT08 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms