Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX16-NPEPL1H3BU86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms