Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMKR1H3BMG3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMKR1H3BMG3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms